Биология

Цифровые методы, корпуса данных, методы машинного обучения активно применяются и в биологии. В статьях рубрики вы узнаете, что такое информатика биоразнообразия и как устроен краудсорсинг биологических данных, как помогает науке оцифровка гербариев, как нейросеть узнает растения и почему она ошибается. В нашей рубрике пишут Ксения Дудова, учёный-ботаник, сотрудник МГУ имени М.В.Ломоносова, кандидат биологических наук по специальностям «ботаника» и «экология» и Алексей Серегин, ведущий научный сотрудник биологического факультета МГУ, доктор биологических наук, руководитель проекта Цифровой гербарий МГУ.
Биология, Тесты

Поповская шапка и провинциальный розен: угадаете ли вы растение по его старинному названию?

Как называли алоэ или шиповник травники XIII века или аптекари времен Петра Великого? Ученые из Европейского университета в Санкт-Петербурге создали базу данных PhytoLex, в которую внесли обозначения растений в ботанических, медицинских и этнографических источниках XI–XVIII веков. Подробно об этом проекте мы рассказали здесь. Предлагаем вам попробовать себя в роли историка ботаники: сможете ли вы угадать современные названия растений по их «паспортным данным» из прошлого?
Биология, Филология

Зачем нужна этноботаническая база данных, или Что такое ухемоль

Ухемоль, лоландер, рудада — спорим, вы не слышали таких слов? Мы тоже, пока не начали составлять этноботаническую базу данных PhytoLex. Рассказываем, для чего используется эта база данных и что можно узнать с ее помощью: от этимологии слова до его эволюции сквозь века.
Биоинформатика, Биология

Тайны древней ДНК: как палеогенетика и биоинформатика помогают археологам

Можно ли узнать, чем болели люди в каменном веке, изучив остатки ДНК из их зубов? Да, если на помощь придут палеогенетика в связке с биоинформатикой. Палеогенетика изучает древнюю ДНК, чтобы понять, куда и откуда мигрировали древние люди, какие возбудители вызывали эпидемии, какие виды гибризовались, чтобы получился современный человек. Об этих подходах рассказывает Андрей Макашов, преподаватель специалитета в Высшей школе биомедицинских систем и технологий петербургского Политеха.
Биоинформатика, Биология

Криминалистическая биоинформатика: как пыльца, грибы и микробы помогают раскрывать преступления

Помните, как в сериале BBC Шерлок Холмс по составу налипшей на кроссовки пыльцы выясняет, где жил их владелец? Это не фантазия сценариста, а научный метод геолокации, которому больше 55 лет. В нашем материале рассказываем, как по следам пыльцы раскрывают преступления, зачем криминалистам ДНК растений и можно ли по пыли на вашей двери определить, где вы живёте.
Биология, Общество

Как понять, что кошке больно: определитель кошачьих эмоций по мимике

Как понять, что кошке больно? Пытаясь ответить на этот вопрос, учёные снимали на видео кошек после операций, измеряли углы отклонения ушей и расширение глаз, а затем проверяли результаты статистическими тестами. В итоге получилась шкала кошачьей мимики, сверяться с которой может каждый хозяин.

Биология, Тесты

Испытание ботаника: тест по растениям России из Цифрового гербария МГУ

Сможете отличить одуванчик от подорожника? Проверьте, насколько хорошо вы знаете растения — узнайте их по изображению из гербария.
Биология

Мне нужны твоя геолокация, камера и телефон: для чего ученым ваши фото птиц и растений

Что такое «гражданская наука» (citizen science)? Как определить редкий вид орхидеи? И зачем фотографировать углозубов? Читайте в новом материале СБъ
Биология, Новости

Храпящие мини-пиги помогут победить апноэ

Анализ дыхательного потока свиней помог ученым прийти к пониманию, что происходит в организме во время эпизодов приостановки дыхания во сне
Биология, Новости

Большие данные против инфаркта и диабета

С помощью больших данных жизнь человека можно представить ​​как траекторию качественных или количественных характеристик в многомерном пространстве. Одновременный анализ таких траекторий помог разработать персонализированный подход в терапии диабета и инфаркта миокарда

структура белков
Биология, Новости

Нейросети научили определять структуру белка

Исследователи из компании Google создали алгоритм, который распознает строение белка. Биологи решали эту задачу 50 лет

птицы москвы
Биология

Видно птицу по полету, а данные о ней — по базе

Какие привычки у птиц, где они обитают и что едят? Проект «Птицы Москвы и Подмосковья» собрал фото, видео с камер наблюдения и сообщения горожан о пернатых на одном сайте. Рассказываем, чем полезен ресурс для исследователей-орнитологов и любителей птиц
Биология, Как это работает

Почти «Робоцып»: в чем польза роботов-животных?

При создании роботов изобретатели и разработчики часто ищут вдохновение в животном мире. Они стараются не только придать механизмам внешний вид живых существ, но и сохранить их полезные качества. Выясняем, какие устройства-животные уже существуют и как они служат людям
Биология, Как это работает, Компьютерное зрение

Как нейросеть узнает растения и почему она ошибается

Автоматические определители живых организмов стоят на смартфонах миллионов любителей природы. Достаточно просто навести камеру на растение или животное, чтобы определить, что это. Разбираемся, как устроены такие приложения и что у них под капотом
Биология, Открытые данные

Цифровой гербарий МГУ: новая жизнь исторической коллекции растений

Второй по величине гербарий в России обрел цифровую форму. В свободном доступе более одного миллиона изображений с оригинальными оцифрованными этикетками и геопривязкой. Настраиваемая система поиска делает цифровой гербарий полезным инструментом как для исследователей, так и для любителей живой природы
Биология, Открытые данные

Цифровые данные по биоразнообразию: как мы стали обладателями сокровищ

Агрегаторы биологических данных появились не так давно, но благодаря ним биология стала гораздо ближе к анализу данных. Теперь каждый ученый может получить миллионы записей из биологических баз на свой компьютер. Рассказываем про главные базы данных о биоразнообразии. По неслучайному совпадению очередная биологическая статья «Системного Блока» выходит в день рождения великого Н. Н. Дроздова :)
Биология, Нейронауки

Цифровое окно в природу

Миллионы людей по всему миру помогают науке, собирая фотографии живых организмов и пополняя гигантскую базу iNaturalist. Из-за пандемии снимать стало сложнее, но помочь науке все равно можно. Рассказываем, как это сделать
Биология

В лес за большими данными: как ваши фотки белок и грибов помогут науке

Если у вас есть смартфон — вы можете почувствовать себя немного биологом и внести вклад в науку. Информатика биоразнообразия — новая область науки, которой помогают тысячи добровольцев. О том, как устроен краудсорсинг биологических данных и как в нем поучаствовать, специально для читателей «Системного Блока» рассказывает доктор биологических наук Алексей Серегин
Биология, Визуализация

Графики, которых мы еще не видели: как биологи визуализируют данные

Если вам кажется, что самое странное изображение в биологии — это препарированная лягушка, вид сбоку, то спешим вас разубедить: биологи успешно создают визуализации для самых разнообразных данных. О некоторых из них речь пойдет в нашей статье

,
Биология

Бабочки, сканеры и льнянка-мутант: как оцифровка гербариев помогает ботаникам по всему миру

Цифровыми библиотеками и цифровыми музеями уже никого не удивишь — но как насчет цифровых гербариев? Огромные коллекции растений уже доступны в сети — и это важно не только для ученых, но и для всех, интересующихся живой природой. Как поучаствовать в биологическом краудсорсинге, зачем нужен новый «Ковчег» и кому сегодня может понадобиться лютик из середины ХХ века?

,